La Estación Experimental es sede de tres Programas Nacionales: Programa Nacional de Investigación en Producción Frutícola, Programa Nacional de Investigación Producción Hortícola y Programa Nacional de Investigación en Producción Familiar. También se realizan en INIA LB proyectos investigación de los Programas: Producción y Sustentabilidad Ambiental, Citrícola, Arroz, Carne y Lana, Forestal, Lechería,Pasturas y Secano.

INIA LB es además sede de otras unidades nacionales que se ubican en la Estación Experimental; tal es el caso de la Unidad de Biotecnología, la Unidad de Agroclima y Sistemas de Información (GRAS), y la Unidad de Comunicación y Transferencia de Tecnología.

En ella se asienta conjuntamente un equipo que trabaja en Mejoramiento Genético Animal, que apoya a los programas de Producción Animal de INIA.